JĀNIS APEINIS absolvējis Jāzepa Vītola Latvijas Mūzikas akadēmijas Vokālo nodaļu (2002) un maģistrantūru (2004) pie prof.Arvīda Imanta Lustes. Apmeklējis meistarklases pie Rašeles Šulovas (1999), Aksela Bauni (2002) un Rolando Panerai (2002). Kopš 2004.gada Jānis Apeinis papildina vokālo meistarību Margaritas Gruzdevas vadībā.
Latvijas Nacionālajā operā debitējis 2003.gadā.
A/S Staburadze stipendiāts Jāzepa Vītola 2.Starptautiskajā vokālistu konkursā, SIA Eniro un Jaunrades fonda stipendiāts (2003), Jāzepa Vītola 3.Starptautiskā vokālistu konkursa laureāts (2004).
2008.gadā iestudējis titullomu Brigites Fāsbenderes iestudētajā P.Čaikovska operā "Jevgeņijs Oņegins" Tiroles Valsts teātrī Insbrukā (Austrija). AS Latvijas Gāze Gada balvas Operai laureāts kā Labākais operas solists (2008).
2009.gada pavasarī sniedzis pirmo solokoncertu Rīgā, kas notika LNO Beletāžas zālē.
